1899年7月9日——俄罗斯皇帝尼古拉二世颁布法令，在符拉迪沃斯托克开设东方学院，这是该国东西伯利亚和远东地区的第一所古典高等教育机构。1899年10月21日——东方学院成立，圣彼得堡大学东方语言系教授、国务委员阿列克谢·波兹涅耶夫被任命为首任校长。1918年——在东方学院的支持下，私立历史语言学系和高等理工学院成立。1920年——东方学院和几所私立教育机构合并为国立远东大学。1930年——国立远东大学进行改革，并以其院系为基础成立独立大学：古比雪夫远东理工学院（自1992年起为远东国立技术大学）和远东国立大学。1953年 — 乌苏里斯克国立师范学院成立，其历史源于1909年在尼科尔斯克-乌苏里斯克开设的女子师范学院。1964年——莫斯科普列汉诺夫国民经济学院符拉迪沃斯托克分校在符拉迪沃斯托克成立，1968年改建为苏联远东贸易学院（FEIST），2004年改建为太平洋国立经济大学。1960年至2010年——滨海边疆区高等教育快速发展，新院系、研究所和研究单位的开设，教学楼和宿舍的建设，实验室的装备，领先的研究和教育学校的形成奠定了基础对于现代远东联邦大学。2010–2011 — 远东联邦大学 (FEFU) 由远东四所顶尖大学合并而成：远东国立大学 (FENU)、远东国立技术大学 (FESTU)、太平洋州立经济大学 ( PSUE）和乌苏里斯克国立师范学院（USPI）。相关法令由俄罗斯总统签署。
2010年12月17日——俄罗斯政府批准了2019年之前的远东联邦大学发展计划。2012年9月2日至9日——远东联邦大学新校区成为亚太经合组织（APEC）峰会举办地。在峰会的最后一天，俄罗斯总统普京向远东联邦大学学生赠送了一把具有象征意义的校园钥匙。2013 年 7 月 1 日 —远东联邦大学医疗中心投入使用，这是俄罗斯远东地区最现代化的诊所，符合最高的国际标准。该中心配备了独特的设备，根据最新的医学发展为患者提供专业的高科技医疗援助、诊断和康复。2013年7月——远东联邦大学成为俄罗斯教育和科学部选定参与增强俄罗斯大学国际竞争力世界领先研究和教育中心计划（5top100项目）的大学之一。2013年9月1日——远东联邦大学新校区第一学年开始。俄罗斯总统弗拉基米尔·普京向学生和教师表示祝贺。2014年11月，俄罗斯总统普京参观了远东联邦大学新实验楼，这里集中了该校最大的科学实验室和世界水平的实验设备。2015年9月——根据俄罗斯总统令，远东联邦大学主办了首届东方经济论坛（EEF）。2016年第二届EEF共有2500名与会者、来自28个国家的57家国际公司的高层管理人员以及200多家俄罗斯公司的首席执行官参加。2016年——远东联邦大学在QS世界大学排名中跻身551-600名的大学行列。该大学还进入了QS新兴欧洲和中亚以及QS世界大学排名：金砖国家的前100名。
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